در حال حاضر بيش از 45 سال از تأسيس و موجوديت آزمايشگاه گياهپزشكي كرج مي گذرد. در سال 1350 اين آزمايشگاه از تغيير ساختار آزمايشگاه بررسي آفات چغندرقند كه واحدي تحقيقاتي در درون بنگاه توليد و اصلاح بذر چغندرقند سابق"موسسه تحقيقات، اصلاح و تهيه بذر چغندر" بود، بوجود آمد و به طور قانوني به موسسه تحقيقات آفات و بيماريهاي گياهي تحويل داده شد. تا سال 1358 اين آزمايشگاه با دو نفر محقق و با لوازم و فضاي محدود و در داخل سه اطاق و با حداقل امكانات وظايف محوله از طرف مؤسسه متبوعه را انجام مي داد . در سال 1366 ساخت آزمايشگاه جديد آغاز شد و در سال 1367 مورد بهره برداري قرار گرفت. سپس در سال 1372، گلخانه هاي تحقيقاتي آن نيز آماده بهره برداري گرديد. مساحت كل زمين واگذاري شده 6000 متر مربع و زيربناي آزمايشگاه و گلخانه هاي تحقيقاتي بيش از 11000 متر مربع مي باشد. گلخانه هاي تحقيقاتي مجهز به سيستم كنترل حرارت، رطوبت و نور مي باشد. از سال 1383بر اساس تفاهم‌نامه با موسسه تحقيقات اصلاح و تهيه نهال و بذر سطحي معادل 16 هكتار زمين زراعي از ضلع شمالي مزرعه 500 هكتاري آن موسسه جدا و به عنوان بستر آزمايشي در اختيار موسسه گياه پزشكي و اين آزمايشگاه قرار گرفت و پروژه‌هاي تحقيقاتي متعددي در زمينه هاي گوناگون گياهپزشكي در آن انجام شده و يا در دست اجرا است. از سال 1393، سطح مزرعه آزمايشي، با توجه به نيازهاي تحقيقاتي موسسه اصلاح و تهيه نهال و بدر، به 10 هكتار كاهش يافت.

• برگزاري كارگاههاي آموزشي - علمي جهت محققين، كشاوزان و باغداران.
•  مشاركت و مصاحبه با راديو البرز در خصوص كنترل آفات، بيماري‌هاي گياهي و علف هاي هرز مزارع و باغات.
• شرکت در جلسات سازمانها، موسسات و معاونت‌هاي اجرايي وزارت متبوع و ارایه مشاوره و راهکار در موارد مربوطه.
• ارزیابی مقالات جهت طرح در کنگره ها و همایشها.
•  ارزیابی و داوری مقالات ژورنالهای علمی داخل و خارج از کشور.
• آموزش كارشناسان معرفي شده از سوي نظام مهندسي.
• راهنمايي و مشاوره دانشجويان نحصيلات تكميلي در رشته هاي مرتبط زير مجموعه گياهپزشكي.
•  آموزش دانشجويان كارورز معرفي شده از سوي موسسه تحقيقات گياهپزشكي.

نشريه هاي ترويجي

- دست نامه های ترویجی

-تكنولوژي كاربرد عوامل بيولوژيك

-مديريت تريپس در مزارع پياز

-  آشنايي با آفات كليدي گياهان گلخانه اي

-ارائه راهكارهاي نوين در مديريت آفات گلخانه‌اي

- توصيه و ترويج كشاورزي ارگانيك و محصول سالم

- طراحي و ساخت دستگاه موتوري جمع آوري آفت سرخرطومي يونجه (با كمك موسسه تحقيقات فني و مهندسي)

- استفاده از روش ماخار و جابجایی جوی با پشته برای مدیریت علف‌های هرز

• بررسی اکولوژی حشرات و تغييرات جمعيت آن‌ها متاثر از عوامل زنده و غيرزنده
•  بررسی بیولوژی حشرات
•  بررسي جنبه هاي مختلف مبارزه زراعي
• تحقيق در زمينة مديريت تلفيقي آفات، بيمارهاي گياهي و علف هاي هرز.
• بررسي و اصلاح پروپوزال‌هاي ارجاعي از كميته هاي محترم علمي موسسه.
• داوري گزارش‌هاي طرحهاي تحقيقاتي از مراكز تحقيقاتي ارسال شده توسط كميته هاي محترم علمي موسسه.
•  انتشار نتايج تحقيقات انجام شده به صورت مقاله هاي علمي و تحقيقاتي
•  تماس دايمي وتبادل اطلاعات علمي با مراجع مشابه علمي داخلي و بين المللي به منظور آگاهي از آخرين اطلاعات مربوطه.
•  بررسی تاثیر سموم مختلف بر روی حشرات، قارچ‌هاي بيماريزا و علف هاي هرز محصولات مختلف و تایید کارایی آنها جهت ثبت سموم درخواستی شرکتها
• بررسی تاثیر فرومونهای مختلف تولید داخل و خارج کشور
•  هدایت و مشاوره دانشجویان کارشناسی ارشد و دکترا
• هدایت دانشجویان کارشناسی در دوران کارآموزی
•  تهیه دستورالعمل های مختلف جهت کنترل آفات، بيماري ها و علف‌هاي هرز محصولات باغی، زراعی و گلخانه ای
• ارایه راهکارهایی جهت کاهش مصرف سموم
• پاسخ به سئوالات فني درخواست شده از طرف افراد، سازمان‌ها و موسسات داخلي و خارجي.
• انجام ساير امور محوله.

آزمایشگاه تحقیقات بیماری‌های گیاهان

این آزمایشگاه در راستای اهداف موسسه تحقیقات گیاه‌پزشکی کشور در زمینه‌های اتيولوژي (سبب شناسي)، بيولوژي و اكولوژي عوامل بیماریزای گیاهی و اپيدميولوژي و مديريت تلفیقی بیماری‌های گیاهان فعالیت دارد. همكاري با دانشگاه‌ها در راهنمايي و مشاوره پايان‌نامه‌هاي دانشجويي و تدوین و اجرای پروژه‌های تحقیقات مشترک با موسسات تحقیقاتی کشاورزی از جمله اهداف مهم این آزمایشگاه است. همچنین بررسی بیماری‌های گیاهی باغات و مزارع استان البرز و ارائه طریق با همکاری سازمان جهاد کشاورزی استان البرز و همکاری با سازمان نظام مهندسی استان جهت آموزش بهره‌برداران و کارشناسان عرصه کشاورزی از افتخارات این آزمایشگاه می‌باشد.

آزمایشگاه اکوفیزیولوژی علف‌های هرز

فعالیت های این آزمایشگاه در ادامه و تکمیل تحقیقات مزرعه‌ای است. بطور مثال نمونه‌های علف‌های هرز در پروژه های تحقیقاتی بعد از انتقال از مزرعه به آزمایشگاه، ابتدا برحسب گونه تفکیک شده و بعد از شمارش و تعیین تراکم آن‌ها در واحد سطح برای اندازه گیری میزان ماده خشک در دستگاه آون قرار گرفته و پس از خشک شدن توزین می‌شوند. بر حسب نوع پروژه و اهداف آن فعالیت‌های نظیر اندازه گیری شاخص‌های فیزیولوژیکی مرتبط با گیاه زراعی و علف‌های هرز، تعیین قوه نامیه بذر، شکستن خواب بذر و ... نیز انجام می‌گیرد. همکاری با سازمان جهاد کشاورزی استان البرز و سایر موسسات تحقیقاتی مستقر در استان و توصیه روش‌های مدیریت علف‌های هرز به بهره برداران بخش کشاورزی اعم از کارشناسان، باغداران و کشاورزان منطقه از سایر فعالیت‌های این آزمایشگاه می‌باشد.

آزمايشگاه تحقيقات حشره شناسي كشاورزي

-     شناسايي و معرفي تعدادي از آفات مهم محصولات زراعي، باغي و گلخانه اي

-     شناسايي ناقلين بيماري‌هاي ويروسي سبزي و صيفي

-     زيست سنجي آفات كليدي محصولات كشاورزي به آفت‌كش هاي جديد

-     پرورش آفات كليدي و برخي گونه هاي ديگر حشرات در آزمايشگاه و گلخانه

-     ارزيابي و ثبت حشره كش ها و كنه كش هاي جديد در مزارع، باغات و گلخانه

-     ارائه روش‌هاي نوين كنترل شيميايي در مديريت آفات

-     بهينه سازي مصرف سموم آفت كش و استفاده از حشره كش هاي ارگانيك

- تعامل با سازمان جهاد كشاورزي استان البرز در ترويج راهكارهاي جديد در مديريت آفات

-     همكاري با پژوهشگاه بيوتكنولو‍ژي ، موسسه تحقيقات فني و مهندسي ، موسسه تحقيقات اصلاح و تهيه نهال و بذر، و پژوهشكده باغباني در تدوين و اجراي پروژه هاي مشترك

-     همكاري در حل مشكلات گياهپزشكي موسسات تحقيقاتي مجاور و فضاي سبز مجتمع تحقيقاتي كشاورزي كرج