بخش تحقيقات آفات و بيماريهاي گياهي مركز تحقيقات كشاورزي آذربايجان غربي بمنظور رفع معضلات گیاه‌پزشکی منطقه و پاسخگویي به نيازهاي كشاورزان و باغداران استان در سال 1346 با نام آزمايشگاه بررسي آفات و بيماريهاي گياهي اروميه تحت هدايت و پشتيباني موسسه بررسي آفات و بیماریهای گیاهی در يك ساختمان استيجاري با دو نفر محقق كه قبلاً در انستيتوي مذكور مشغول بكار بودند شروع بكار نمود. در سال‌هاي بعد تعداد محققين به 4 نفر رسيد و يك نفر مسئول امور دفتري، يك نفر مسئول امور مالي، 4 نفر تكنسين، 4 نفر باغبان، 4 نفر راننده خود رو نيز محققين را ياري مي‌كردند. در سال 1356 آزمايشگاه به ساختمان جديدي كه در محوطه پنج هكتاري در جاده اروميه سلماس، جنب سازمان جهاد کشاورزی ساخته شده بود تغيير مكان داد. ساختمان جديد به شش دستگاه خانه سازماني، زمين ورزشي ، استخر شنا، تعميرگاه ماشين آلات ، هانگار، گلخانه، سالن كنفرانس، كتابخانه، موزه حشرات، اطاق‌هاي حرارت ثابت، آزمايشگاه‌هاي آفات، بيماريهاي گياهي و علفهاي‌هرز مجهز بود و براي كارگاهاي شيشه‌گري، نجاري و آهنگري فضاهایي در نظر گرفته شده بود. در سال 1364 بواسطه تأسيس مركز تحقيقات كشاورزي، قسمت‌هایي از ساختمان به بخش‌هاي اصلاح بذر، چغندر قند، و خاكشناسي اختصاص يافت  و آزمايشگاه نيز بعنوان يكي از بخش‌هاي تابعه اين مركز درآمد. اين بخش در سال جاري در مجموع 24 طرح تحقيقي در زمینه‌هاي آفات و بيماريهاي گياهي و علف‌هاي هرز محصولات باغي و زراعي در دست اجراء دارد.