تأسیس بخش تحقیقات گیاه‌پزشکی جنوب کرمان (جیرفت) به فروردین 1346 و انتقال آزمایشگاه بررسی آفات و بیماریهای گیاهی از زاهدان به جیرفت بر می‌گردد. آزمایشگاه بررسی آفات و بیماریهای گیاهی زابل که توسط شرکت ایتال کنسول و ذیل انستیتوی بررسی آفات و بیماری گیاهی کشور شکل گرفته بود، به لحاظ اهمیت و پتانسیل کشاورزی منطقه جیرفت و درپی تفاهم صورت گرفته بین انستیتوی بررسی آفات و بیماری گیاهی کشور و سازمان عمران جیرفت در سال 1346 به جیرفت منتقل و فعالیت خود را در یک منزل استجاری واقع در خیابان فعلی ابومسلم 5 آغاز کرد. مهندس احمد خیرخواه (سرپرست آزمایشگاه) به همراه یک نفر حسابدار (احمد کاظمی) و یک نفر راننده (حسن بخشی) و با انتقال تجهیزات آزمایشگاه شامل یک دستگاه میکرسکوپ چشمی، یک دستگاه سمپاش، تعدادی میز و صندلی، تعدادی لوله و ظروف آزمایشگاهی و یک دستگاه خودرو لندرور به جیرفت، آزمایشگاه بررسی آفات و بیماری های گیاهی جیرفت را راه اندازی کردند. پس از استقرار آزمایشگاه، ابتداء مهندس حسین فریور مهین تا شهریور 1346 و سپس شاپور باروتی (نماتود شناس) در سال‌های 1346 تا 1355 سرپرستی آزمایشگاه را برعهده داشتند. بعد از ایشان مهندس ولی الله غدیری بمدت یکسال (تا سال 1356) سرپرست آزمایشگاه بودند. در این سال مهندس احمد فرید نیز به عنوان کارشناس جذب و مشغول بکار شد. طی این سالها فعالیت‌های آزمایشگاه عمدتا بر جمع آوری و شناسایی فون و فلور حشرات، آفات گیاهی، بیماریهای گیاهی و علفهای هرز و همچنین مقایسه کارایی سموم برای کنترل آفت کرم خاردار پنبه معطوف بود. از سال 1356 مهندس احمد فرید سرپرستی آزمایشگاه بررسی آفات و بیماریهای گیاهی جیرفت را برعهده گرفتند. در سال 1367 و با ارتقاء آزمایشگاه به مرکز تحقیقات کشاورزی جیرفت و بم و انتصاب مهندس فرید به ریاست این مرکز، مهندس نرجس جلیانی ریاست بخش تحقیقات آفات و بیماریهای گیاهی بعنوان یکی از بخش‌های تابعه این مرکز را بر عهده گرفتند.

با پیگیری‌های مستمر مهندس فرید، ساختمان اداری و آزمایشگاهی بخش (که درحال حاضر نیز استفاده            می شود) به متراژ 1500 متر مربع و مطابق نقشه ارسالی انستیتوی تحقیقات آفات و بیماریهای گیاهی در روستای علی آباد عمران توسط سازمان عمران جیرفت ساخته شد. در اواخر سال 1356 آزمایشگاه بررسی آفات و بیماری ها از محل استیجاری در شهر جیرفت به این مکان منتقل شد. بعلاوه جذب نیروهای کارشناسی، فنی و اداری به تدریج انجام و فعالیت پژوهشی این آزمایشگاه با اجرای طرح های تحقیقاتی درخصوص آفات سن گندم و پروانه برگخوار مرکبات آغاز شد.

این بخش در حال حاضر با بهره‌مندی از توان علمی شش نفر محقق و عضو هیأت علمی و پشتیبانی پنج نفر پرسنل فنی و خدماتی، هر ساله حدود 20 پروژه تحقیقاتی در زمینه های مختلف کشاورزی و در راستای سیاست‌های ابلاغی موسسه تحقیقات گیاه‌پزشکی کشور و نیاز دستگاه‌های اجرایی به انجام می‌رساند. محور این پژوهش‌ها، شناسایی عوامل خسارتزای گیاهی و ارائه راه‌هاي مدیریت کنترل آفات، بيماريها و علف‌هاي هرز گياهان زراعي و باغي منطقه با استفاده از روش‌هاي متناسب با اصول کشاورزي پايدار مي‌باشد. آموزش عملی دانشجویان گیاه‌پزشکی دانشگاه‌های مختلف در قالب دوره‌های کارآموزی و بررسی نمونه‌های گیاهی و راهنمایی کشاورزان و باغداران منطقه از سایر فعالیت‌های جاری این بخش است.

هم اکنون اين بخش شامل واحدهاي تحقيقات آفات گیاهان زراعی و گلخانه‌ای، آفات درختان میوه، علف‌هاي هرز، بيماري‌هاي قارچي، باکتريائي و ويروسي و نماتودهاي گياهي است. تجهيزات اين بخش تحقيقاتي شامل: آزمايشگاه‌هاي حشره‌شناسي، آفات گیاهان زراعی و باغی، بیماریهای قارچی، نماتودشناسی، آزمایشگاه و هرباريوم علف‌هاي هرز، گلخانه تحقيقاتي، دو باب اطاق حرارت ثابت، آزمایشگاه کشت بافت گیاهی، میکروپلات، آزمایشگاه بیماری شناسی گیاهی مولکولی و مجموعه تنوع زیستی و ذخایر ژنتیکی گیاه‌پزشکی است. نتایج حاصل از تحقیقات بعمل آمده، بویژه در خصوص محصولات باغی و گلخانه‌ای، در سطح وسیعی مورد استفاده کشاورزان منطقه قرار می‌گیرد.

- شناسایی علل بروز عارضه خشکیدگی خرما و ارائه راهکار عملی و به زراعی جهت کاهش خسارت آن.1383

- تکنولوژی پرورش آزمایشگاهی سن شکارگر Nesidiocoris tenuis برای کنترل سفید بالکها و شب پره مینوز گوجه فرنگی. 1395

- مطالعه بیواکولوژی سپردار شرقی مرکبات و ارائه برنامه کنترل غیر شیمیایی ان در باغات مرکبات. 1373

- توسعه تکنیک Multiplex PCR  برای ردیابی همزمان عوامل بیماریهای جاروک و میوه سبز مرکبات. 1395

- شناسایی و معرفی 6 رقم گوجه فرنگی فضای باز مقاوم به ویروس پیچیدگی زرد (سرجمک) گوجه فرنگی. 1396

- مطالعه روش آفتاب دهی خاک برای کنترل عوامل بیماریزای خاکزی برای اولین بار در ایران. 1374

- اولین گزارش از کنه زرد پهن سیب زمینی Polyphagotarsonemus latus  در ایران، مطالعه بیواکولوژی آن و ارائه برنامه مبارزه با این کنه. 1383

- معرفی برگخوار خیار Diaphania indica به عنوان اولین گزارش برای فون بال پولک داران ایران. 1384

- شناسایی و معرفی سپردار  Parlatoria cryptaبه عنوان آفت زیتون برای اولین بار از ایران.1380

- اولین گزارش از بیماری فوزاریومی وسمه در ایران. 1385

- اولین گزارش از بیماری پوسیدگی ریشه و طوقه چای ترش در ایران و دنیا. 1383

- شناسایی تعدادی از میزبانهای قارچ ناتراسیا برای اولین بار در دنیا. 1382

- شناسایی و معرفی دو گونه دشمن طبیعی کرم خربزه برای اولین بار از ایران. 1390

- شناسایی و معرفی عوامل جدید پوسیدگی میوه لیمو ترش برای اولین بار در دنیا. 1385

- شناسایی بیماری سیاهک هندی برای اولین بار در ایران. 1374

- ارائه روشهای کنترل غیر شیمیایی آفات و بیماریهای  گلخانه­ای. 1395

- انتقال دانش فنی تکثیر و پرورش انبوه سن شکاری Nesidiocoris tenuis به شرکت فناور پارس کاواندیش هلیل از بخش خصوصی در قالب قرارداد رسمی به شماره 11/280/4441  و تاریخ 24/11/95. 1395

- انتقال دانش فنی تولید کیت تشخیص همزمان دو بیماری گرینینگ و جاروک مرکبات  به شرکت فناور پارس کاواندیش هلیل از بخش خصوصی در قالب قرارداد رسمی به شماره 11/280/4551 و تاریخ 24/11/95. 1395

- انتقال دانش فنی تولید خیار گلخانه­ای سالم  به شرکت زیست فناوران سبزواران از بخش خصوصی در قالب قرارداد رسمی به شماره  11/280/4557 و تاریخ 24/11/95.1395

- تولید محصول خیار سالم گلخانه­ای طبق قرارداد انتقال فناوری بند 40 در سطح صنعتی و فروش آن در بازار. 96.1395

- ایجاد سایت جامع الگویی تولید خیار سالم گلخانه­ای و برگزاری برنامه روزهای ملی مزرعه و کارگاه­های آموزشی تولید محصول سالم گلخانه­ای در سال زراعی 97 - 96. 97.1396

شناسایی عامل و تدوین دستورالعمل مدیریت بیماری زوال مرکبات در جنوب کرمان (دستورالعمل ملی).1397